В управлении у ФГБУ «Нижне-Свирский государственный заповедник» (Учреждения) находятся четыре особо охраняемые природные территории:
1.      государственный природный заповедник «Нижне-Свирский»
2.      государственный природный заказник федерального значения «Мшинское болото»
3.      государственный природный заказник федерального значения «Олонецкий»
4.      государственный природный заповедник «Восток Финского залива»

      Пребывание на территориях государственных природных заповедников физических лиц, не являющихся работниками федеральных государственных бюджетных учреждений, осуществляющих управление государственными природными заповедниками, должностными лицами федерального органа исполнительной власти, в ведении которого находятся государственные природные заповедники, допускается только при наличии разрешения федеральных государственных бюджетных учреждений, осуществляющих управление государственными природными заповедниками, или федерального органа исполнительной власти, в ведении которого находятся государственные природные заповедники.

      За посещение физическими лицами территорий государственных природных заповедников в целях туризма федеральными государственными бюджетными учреждениями, осуществляющими управление государственными природными заповедниками, взимается плата.